slurm

问题描述:SLURM可以实现根据用户的提交脚本描述,将标记的文件拷贝到计算节点并在结束后释放么? 大家好,本文将围绕slurm的三种提交方式中,交互式提交使用的命令是展开说明,slurm提交作业是一个很多人都想弄明白的事情,想搞清楚slurm什么意思需要先了解以下几个事情。

关于slurm配置的问题

slurm的相关图片

我开始使用Slurm,我假设我传递的提交脚本sbatch在控制器上运行,标记的步骤srun将作为计算节点上的作业步骤运行。考虑以下示例:

#!/bin/bash

#SBATCH --cpus-per-task 12#SBATCH --gres=gpu:1#SBATCH --job-name=hello。

hostname

srun hostname

我期待看到我首先提交的机器的主机名,然后是为该作业分配的计算节点的名称。相反,似乎整个脚本都在计算节点上运行。我在日志中看到计算节点的主机名,然后它失败,因为它无法srun在该节点上找到:

如何监控LINUX网络状态的相关图片

如何监控LINUX网络状态

一旦安装完成,你就需要为所要监控的那个网络接口构建一个新的数据库。在你这么做之前,先要确保下列目录存在:

/var/lib/vnstat。

如果该目录不存在,数据库构建就会失败,你最后会看到下列错误:

Error: Unable to open database directory "/var/lib/vnstat": No such file or directory。

The vnStat daemon should have created this directory when started.。

Check that it is is configured and running. See also "man vnstatd".。

如何安装网络流量监控工具vnStat和vnStati?。

Vnstat Error:/var/lib/vnstat。

要是缺少该目录,你可以构建该目录,只要运行下列命令:

# mkdir /var/lib/vnstat。

4. 想为你的网络接口创建一个新的数据库,运行:

# vnstat --create -i eth0。

Creating database for interface "eth0"...。

Info: -> A new database has been created.。

如何安装网络流量监控工具vnStat和vnStati?。

openMP的slurm作业脚本怎么写的相关图片

openMP的slurm作业脚本怎么写

下面是按功能划分的命令名称。

监控总体带宽使用――nload、bmon、slurm、bwm-ng、cbm、speedometer和netload。

监控总体带宽使用(批量式输出)――vnstat、ifstat、dstat和collectl。

每个套接字连接的带宽使用――iftop、iptraf、tcptrack、pktstat、netwatch和trafshow。

每个进程的带宽使用――nethogs。

1. nload

nload是一个命令行工具,让用户可以分开来监控入站流量和出站流量。它还可以绘制图表以显示入站流量和出站流量,视图比例可以调整。用起来很简单,不支持许多选项。

所以,如果你只需要快速查看总带宽使用情况,无需每个进程的详细情况,那么nload用起来很方便。

$ nload

安装nload:Fedora和Ubuntu在默认软件库里面就有nload。CentOS用户则需要从Epel软件库获得nload。

# fedora或centos $ yum install nload -y # ubuntu/debian $ sudo apt-get install nload 。

2. iftop

iftop可测量通过每一个套接字连接传输的数据;它采用的工作方式有别于nload。iftop使用pcap库来捕获进出网络适配器的数据包,然后汇总数据包大小和数量,搞清楚总的带宽使用情况。

虽然iftop报告每个连接所使用的带宽,但它无法报告参与某个套按字连接的进程名称/编号(ID)。不过由于基于pcap库,iftop能够过滤流量,并报告由过滤器指定的所选定主机连接的带宽使用情况。

$ sudo iftop -n 。

n选项可以防止iftop将IP地址解析成主机名,解析本身就会带来额外的网络流量。

安装iftop:Ubuntu/Debian/Fedora用户可以从默认软件库获得它。CentOS用户可以从Epel获得它。

# fedora或centos yum install iftop -y # ubuntu或 debian $ sudo apt-get install iftop 。

3. iptraf

iptraf是一款交互式、色彩鲜艳的IP局域网监控工具。它可以显示每个连接以及主机之间传输的数据量。下面是屏幕截图。

$ sudo iptraf

安装iptraf:

# Centos(基本软件库) $ yum install iptraf # fedora或centos(带epel) $ yum install iptraf-ng -y # ubuntu或debian $ sudo apt-get install iptraf iptraf-ng 。

4. nethogs

nethogs是一款小巧的"net top"工具,可以显示每个进程所使用的带宽,并对列表排序,将耗用带宽最多的进程排在最上面。万一出现带宽使用突然激增的情况,用户迅速打开nethogs,就可以找到导致带宽使用激增的进程。nethogs可以报告程序的进程编号(PID)、用户和路径。

$ sudo nethogs 。

安装nethogs:Ubuntu、Debian和Fedora用户可以从默认软件库获得。CentOS用户则需要Epel。

# ubuntu或debian(默认软件库) $ sudo apt-get install nethogs # fedora或centos(来自epel) $ sudo yum install nethogs -y 。

5. bmon

bmon(带宽监控器)是一款类似nload的工具,它可以显示系统上所有网络接口的流量负载。输出结果还含有图表和剖面,附有数据包层面的详细信息。

安装bmon:Ubuntu、Debian和Fedora用户可以从默认软件库来安装。CentOS用户则需要安装repoforge,因为Epel里面没有bmon。

# ubuntu或debian $ sudo apt-get install bmon # fedora或centos(来自repoforge) $ sudo yum install bmon 。

bmon支持许多选项,能够制作HTML格式的报告。欲知更多信息,请参阅参考手册页。

6. slurm

slurm是另一款网络负载监控器,可以显示设备的统计信息,还能显示ASCII图形。它支持三种不同类型的图形,使用c键、s键和l键即可激活每种图形。slurm功能简单,无法显示关于网络负载的任何更进一步的详细信息。

$ slurm -s -i eth0 。

安装slurm

# debian或ubuntu $ sudo apt-get install slurm # fedora或centos $ sudo yum install slurm -y 。

7. tcptrack

tcptrack类似iftop,使用pcap库来捕获数据包,并计算各种统计信息,比如每个连接所使用的带宽。它还支持标准的pcap过滤器,这些过滤器可用来监控特定的连接。

安装tcptrack:Ubuntu、Debian和Fedora在默认软件库里面就有它。CentOS用户则需要从RepoForge获得它,因为Epel里面没有它。

# ubuntu, debian $ sudo apt-get install tcptrack # fedora, centos(来自repoforge软件库) $ sudo yum install tcptrack 。

8. vnstat

vnstat与另外大多数工具有点不一样。它实际上运行后台服务/守护进程,始终不停地记录所传输数据的大小。之外,它可以用来制作显示网络使用历史情况的报告。

$ service vnstat status * vnStat daemon is running 。

运行没有任何选项的vnstat,只会显示自守护进程运行以来所传输的数据总量。

$ vnstat Database updated: Mon Mar 17 15:26:59 2014 eth0 since 06/12/13 rx: 135.14 GiB tx: 35.76 GiB total: 170.90 GiB monthly rx | tx | total | avg. rate ------------------------+-------------+-------------+------------- Feb '14 8.19 GiB | 2.08 GiB | 10.27 GiB | 35.60 kbit/s Mar '14 4.98 GiB | 1.52 GiB | 6.50 GiB | 37.93 kbit/s ------------------------+-------------+-------------+------------- estimated 9.28 GiB | 2.83 GiB | 12.11 GiB | daily rx | tx | total | avg. rate ------------------------+-------------+-------------+------------- yesterday 236.11 MiB | 98.61 MiB | 334.72 MiB | 31.74 kbit/s today 128.55 MiB | 41.00 MiB | 169.56 MiB | 24.97 kbit/s ------------------------+-------------+-------------+------------- estimated 199 MiB | 63 MiB | 262 MiB | 。

想实时监控带宽使用情况,请使用"-l"选项(实时模式)。然后,它会显示入站数据和出站数据所使用的总带宽量,但非常精确地显示,没有关于主机连接或进程的任何内部详细信息。

$ vnstat -l -i eth0 Monitoring eth0... (press CTRL-C to stop) rx: 12 kbit/s 10 p/s tx: 12 kbit/s 11 p/s 。

vnstat更像是一款制作历史报告的工具,显示每天或过去一个月使用了多少带宽。它并不是严格意义上的实时监控网络的工具。

vnstat支持许多选项,支持哪些选项方面的详细信息请参阅参考手册页。

安装vnstat

# ubuntu或debian $ sudo apt-get install vnstat # fedora或 centos(来自epel) $ sudo yum install vnstat 。

9. bwm-ng

bwm-ng(下一代带宽监控器)是另一款非常简单的实时网络负载监控工具,可以报告摘要信息,显示进出系统上所有可用网络接口的不同数据的传输速度。

$ bwm-ng bwm-ng v0.6 (probing every 0.500s), press 'h' for help input: /proc/net/dev type: rate / iface Rx Tx T ot================================================================= == eth0: 0.53 KB/s 1.31 KB/s 1.84 KB lo: 0.00 KB/s 0.00 KB/s 0.00 KB------------------------------------------------------------------------------------------------------------- total: 0.53 KB/s 1.31 KB/s 1.84 KB/s 。

如果控制台足够大,bwm-ng还能使用curses2输出模式,为流量绘制条形图。

$ bwm-ng -o curses2 。

安装bwm-ng:在CentOS上,可以从Epel来安装bwm-ng。

# ubuntu或debian $ sudo apt-get install bwm-ng # fedora或centos(来自epel) $ sudo apt-get install bwm-ng 。

10. cbm:Color Bandwidth Meter。

这是一款小巧简单的带宽监控工具,可以显示通过诸网络接口的流量大小。没有进一步的选项,仅仅实时显示和更新流量的统计信息。

$ sudo apt-get install cbm 。

11. speedometer。

这是另一款小巧而简单的工具,仅仅绘制外观漂亮的图形,显示通过某个接口传输的入站流量和出站流量。

$ speedometer -r eth0 -t eth0 。

安装speedometer

# ubuntu或debian用户 $ sudo apt-get install speedometer 。

12. pktstat

pktstat可以实时显示所有活动连接,并显示哪些数据通过这些活动连接传输的速度。它还可以显示连接类型,比如TCP连接或UDP连接;如果涉及HTTP连接,还会显示关于HTTP请求的详细信息。

$ sudo pktstat -i eth0 -nt $ sudo apt-get install pktstat 。

13. netwatch

netwatch是netdiag工具库的一部分,它也可以显示本地主机与其他远程主机之间的连接,并显示哪些数据在每个连接上所传输的速度。

$ sudo netwatch -e eth0 -nt $ sudo apt-get install netdiag 。

14. trafshow

与netwatch和pktstat一样,trafshow也可以报告当前活动连接、它们使用的协议以及每条连接上的数据传输速度。它能使用pcap类型过滤器,对连接进行过滤。

只监控TCP连接

$ sudo trafshow -i eth0 tcp $ sudo apt-get install netdiag 。

15. netload

netload命令只显示关于当前流量负载的一份简短报告,并显示自程序启动以来所传输的总字节量。没有更多的功能特性。它是netdiag的一部分。

$ netload eth0 $ sudo apt-get install netdiag 。

16. ifstat

ifstat能够以批处理式模式显示网络带宽。输出采用的一种格式便于用户使用其他程序或实用工具来记入日志和分析。

$ ifstat -t -i eth0 0.5 Time eth0 HH:MM:SS KB/s in KB/s out 09:59:21   2.62 2.80 09:59:22   2.10 1.78 09:59:22   2.67 1.84 09:59:23   2.06 1.98 09:59:23   1.73 1.79 。

安装ifstat:Ubuntu、Debian和Fedora用户在默认软件库里面就有它。CentOS用户则需要从Repoforge获得它,因为Epel里面没有它。

# ubuntu, debian $ sudo apt-get install ifstat # fedora, centos(Repoforge) $ sudo yum install ifstat 。

17. dstat

dstat是一款用途广泛的工具(用python语言编写),它可以监控系统的不同统计信息,并使用批处理模式来报告,或者将相关数据记入到CSV或类似的文件。这个例子显示了如何使用dstat来报告网络带宽。

安装dstat

$ dstat -nt -net/total- ----system---- recv send| time 0 0 |23-03 10:27:13 1738B 1810B|23-03 10:27:14 2937B 2610B|23-03 10:27:15 2319B 2232B|23-03 10:27:16 2738B 2508B|23-03 10:27:17 。

18. collectl

collectl以一种类似dstat的格式报告系统的统计信息;与dstat一样,它也收集关于系统不同资源(如处理器、内存和网络等)的统计信息。这里给出的一个简单例子显示了如何使用collectl来报告网络使用/带宽。

$ collectl -sn -oT -i0.5 waiting for 0.5 second sample... # <----------Network----------> #Time KBIn PktIn KBOut PktOut 10:32:01 40 58 43 66 10:32:01 27 58 3 32 10:32:02 3 28 9 44 10:32:02 5 42 96 96 10:32:03 5 48 3 28 。

安装collectl

# Ubuntu/Debian用户 $ sudo apt-get install collectl #Fedora $ sudo yum install collectl。

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电影脚本一般会列出镜头的长度、景别、构图、配乐等等很详细的信息,拿到它之后你的脑子里就会象看到真正剪辑好的电影一样。脚本一般是用在正式拍摄时导演和摄像,后期编辑时编辑师看的,而剧本只是提供给你一个故事梗概,是提供给导演和演员以及编剧看的。通俗一点说,电影脚本是连环画,电影剧本则是小小说。

原文地址:http://www.qianchusai.com/slurm.html

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