我想说以下几点:
1.SDS-PAGE loading buffer一般配成2X 的,5X loading buffer确实过于粘稠,且SDS在低温下难溶于水,这就导致你配的buffer“摇都摇不动”了。
2.不知你为何要配那么多loading buffer(况且是5X的),这些东西都是用量很少的,建议你少配些,比如……10 ml?。
3.以下就以2X loading buffer(配制10 ml)为例说明配制步骤。
首先配制1 mol/L Tris-HCl(pH6.8),10%SDS溶液.。
然后称取0.02 g溴酚蓝于小烧杯里,依次加入1 mol/L Tris-HCl(pH6.8) 1ml,10%SDS溶液4ml,甘油2ml,去离子水2ml,2-巯基乙醇1ml.混匀,分装成小份,-20度保存.用时溶解,与样品1:1混合上样.。
需要说明的是,2-巯基乙醇是还原剂,也可用前加入,以防失效.。
上样缓冲液也有多种,一般是80ul的样本加20ul的上样缓冲液,这样基本上上样50ug的体积在10ul左右。
最好是测浓度,一般不超过30-40ug,上样缓冲液一般4×或者5×,这个没太大区别。
1.平均值是复孔1和复孔2的总和除以2;
2.将算出的OD平均值(x)代入y=1196.1x-179.87,计算出样品孔的浓度(y);
3.如果在测OD值时,样品孔的OD值大于A孔的OD值,就说明样品孔的浓度偏大(不能代入公式计算浓度),需要成倍稀释后再次测OD值,直到测得的样品OD值在I-A范围之间,即可代入公式计算浓度。根据经验,4°离心后的上清液颜色如果偏黄,蛋白浓度一般很大,需要稀释,蛋清色的上清会比偏黄色的上清浓度略低,所以建议加到96孔板里的蛋白上清液最好稀释一定比例,避免返工。这一步适用于加了稀释液、浓度偏大的样品,在得出y的基础上乘以稀释倍数,得到蛋白的真正浓度;
4.因为标准品的浓度单位是ug/ml,而后面的上样体积单位为ul,所以换算成ug/ul;
5.上样时不单单是蛋白上清液,还要加入成比例的上样缓冲液,这里以5X上样缓冲液为例(4ul的蛋白上清配1ul的上样缓冲液,4:1的关系),所以这一步的上样浓度就变成:蛋白浓度(ug/ul)乘以0.8;
6.上样的总量是一定的,可以是30ug,也可以是50ug,这个值可以通过曝光后条带的颜色深浅来改变总量的多少。上样体积就是上样总量÷上样浓度,这样就算出来每组样品需要加多少ul的上样体积跑胶啦。还有一点要注意的是,如果样品的浓度很低,测出来的体积就会大,因为一个梳子孔最多能注入25ul,尽量不要超过20ul为好,否则跑出来效果不佳。
5x意思是工作浓度的5倍
用的时候使得终浓度为1x就好了。
比如有些预混的PCR buffer是2x的。
对于25ul PCR体系来说,就是取12.5ul的2x buffer。
然后加引物、模板等组分,补水到25ul。
你好,稀释5x电泳缓冲液,只需根据需要的稀释倍数向其中加入适当的蒸馏水混合均匀即可。
稀释的步骤为:计算,取液,移液,洗涤,定容,摇匀,装瓶并贴上标签。